孙奇以为曹皇后不同意，赶紧说道：“微臣也觉得这个方子不合适，当时就是用了这个方子，二皇子就死了，但是，知秋国舅说过，家父这个方子正是治疗逆传心包的方子，只是，为什么没有效果，他也不知道。”
曹皇后苦笑：“因为当时我们给二皇子服用高丽人参燕窝等温补的药，而且，还有附子！而知秋说，温病不能温补，高丽人参等温补药扰乱了方药，导致进一步的变证，同时，他说我们加的附子炮制不对，有毒！所以孙老太医的方子才没有效果。”
孙奇惊讶得眼睛都瞪圆了，可是，他不敢建议那就用父亲的这个方子，毕竟，这是给皇帝治病！而父亲的这个方子是不是这个原因才没有效果，谁也说不清。便只是垂手而立，等着皇后自己决定。
事关用药问题，皇后自己也不敢乱拿主意，还是询问专业人士的好。曹皇后立即将侍御医林忆、苏颂叫来，把孙奇的建议说了。问他们两的意见。
用孙用和治死二皇子的方子？两人一听就傻眼了。
林忆捻着胡须半晌才说道：“这个……，二皇子的误治病案已经证明了这个方子不对，再用，只怕还是一样。如果明明知道这个方子不能治逆传心包，却还是用的话，只怕……
曹皇后便把叶知秋指出的温病误用温补和附子炮制不好有毒这才导致方子无效的看法告诉了他们。
苏颂喜道：“如果知秋国舅的确这么说过，那他应该不会是乱说的，说不定真的有效！”
林忆却摇头道：“这也难说，或许只是知秋国舅为了救孙用和太医才故意说他的方子有效，找了这样一个借口，如果是这样，那这个方子用了只怕会出问题！”
苏颂急了：“现在这是最后的希望了，不用这个方子，又用什么？莫非你有更好的选择？”
“我没有，但是，就算是没有更好的办法，也不能用未经证明的方子！这是死的规定！否则就是不如本方！”
苏颂也傻眼了，他知道林忆说的是对的，给皇帝治病，你可以平庸治不好，但是绝对不能凭自己的经验用没有经过检验的方子，否则孙用和就是他的榜样！
他们可以明哲保身，曹皇后不能，病危的是他的丈夫啊。这时候只有她可以决定是是否使用这个方子，但是，一旦失败，想起当初二皇子惨死在自己怀里的情景，她全身颤栗，绝望地望着孙奇，想从他那里找到可以下决心的依据。
孙奇道：“这个方子，微臣听家父说，他曾经用过，治疗过一些类似的病人，疗效是满意的。不过，我没有亲眼见过，因为有些方子，家父并没有传授给微臣，所以不知道他治好的病人中，那些是用了这个方子治好的。
曹皇后瞧着孙奇：“你果真听过知秋说过这个方子可以治逆传心包吗？”
孙奇点点头。
“你能肯定他的确这么说过？”
“我能肯定！”
旁边林忆也道：“微臣也听知秋国舅说过。微臣可以证明！”
曹皇后自己也听叶知秋说过，不明确，现在有两个可以证明，她脸上浮现出了希望。又问孙奇：“你确定听过孙老太医说过，他用这个方子治好过类似病人？”
“这一点微臣可以用脑袋担保，家父的确是这么说过的。当时舍弟和犬子也听见了的。”
曹皇后在屋里转了几个圈，终于站住，毅然道：“用！孙太医，由你来下方！你给官家主治！”
孙奇吓了一跳：“我？”
“嗯！放心，出了问题，本宫恕你无罪！”
孙奇这才松了一口气，随即立即明白，这个方子在二皇子的病案里是现成的，为什么曹皇后不让照方抓药，反而让自己下一个方子，并让自己主治，又说明出问题恕自己无罪，那就是说，一旦有了功劳，那功劳可就是自己的，那就可以因为救治官家有功，而请求赦免弟弟孙兆一家了。当然，如果这个方子有效，甚至可以据此证明父亲孙用和无罪！
一想到这，孙奇紧张得全身都是汗，这个方子他已经烂熟于胸，当下提笔哆哆嗦嗦写了，双手递给皇后。曹皇后接过，一双柔荑也在微微颤抖，终于将方子交给尚药局照方抓药。
汤药煎好，赵曙亲自尝药，这是规矩，以防有人下毒。然后，曹皇后亲自给仁宗皇帝用鹤嘴壶灌下。
接下来，就是焦心的等待了。
静静的等待中，孙奇不时探查仁宗的身热，只过了两个时辰，孙奇就惊喜而略有些迟疑地说道：“好象……，好象热退一些了！”
曹皇后又惊又喜，紧忙过来亲手在仁宗脑门一摸：“果真是的，这说明有效了吗？”
孙奇想点头，可是，这个判断太重要了，重要到让他没有了自信，望向侍御医林忆和苏颂。
两人忙也过来摸了摸，苏颂欢喜得白胡子乱抖：“真的！真个退烧了！开始好转了！”
林忆也欣喜万分，连连点头。
屋里守候的嫔妃们都是喜极而泣。
等到半夜，不仅高热进一步退了，而且，深夜里，还嘟哝了几句谁也不知道什么意思的话，不过这已经让屋里的人欢喜得又哭又笑了，因为连续几天仁宗都是高热昏迷不醒，连胡话都没有了的。
深夜又服了一次药之后，到了黎明时分，仁宗竟然睁开眼，说了句——“朕还活着？”
听到这句话，屋里一片欢腾！
也正是有了这一句，三位太医终于敢确定，孙用和太医的方子有效！
孙奇禁不住落泪，只可惜自己的老父亲看不到这一幕。
又用药数次之后，终于，仁宗高热尽退，神志完全清醒，能吃能拉了，只是高热灼津，孙奇又跟两位侍御医商议之后，下方生津养液。身体进一步康复。听了仁宗说了救治经过，听说自己一条性命竟然老太医孙用和当年给二皇子治疗同样的病的方子，仁宗怔怔出神半晌，潸然泪下。
仁宗到不是一个固执成见的昏君，他知道自己错了之后，立即下旨，将孙兆一家无罪释放，官复原职。并下旨给孙用和平反。
这时候，持续在成外四处搜寻叶知秋他们的御林军终于根据叶知秋他们的烟火找到了他们。
叶知秋先把可馨送回家，然后回到家里。王妃、岳氏和范妙菡等人是喜极而泣。叶知秋得知仁宗已经下旨将孙兆他们一家无罪释放，官复原职，并给爷爷孙用和平反了，非常的高兴。特意跟母亲岳氏到孙家探望。
孙兆已经从之兄长孙奇那里得知这这件事的前因后果，知道如果不是叶知秋传授了逆传心包的温病知识，同时又指出了孙用和的方子能治疗逆传心包，孙奇不可能治好仁宗皇帝的病，又听说叶知秋为了拯救他们作出的种种努力，一家人都十分的感动。所以见到叶知秋，孙兆拿拉着他的手，是声泪俱下。以前对他不好的孙永辕，知道自己一家的性命都是弟弟所救，惭愧得无地自容。
叶知秋问起给皇帝治病的经过，虽然皇家医案都是绝密的，但是这个成功医案主要得益于叶知秋的指点，叶知秋的特殊身份也可以知道这个病案，所以孙奇还是告诉了他经过。
叶知秋听了大喜，说道：“这下可以证明温病不同于伤寒了吧？证明我说得是对的吧！”
孙奇好孙兆互看了一眼，这个问题他们已经商讨过了，眼看叶知秋兴高采烈的样子，也不好扫他的兴，便打折哈哈没有接话。
叶知秋有些奇怪，问道：“难道不是这样吗？”
孙奇想了想，道：“知秋，我们很感激你为拯救孙家而想出的这个办法，而且老天爷有眼，也实现了这个目标，但是，具体说道温病与伤寒，我们还是觉得，两者没有大的不同，当然，你发现了温病之处用辛温可能会出现的逆传心包的治法，这非常好，但是，这也只是温病伤寒治疗中出现的一种变证，而不能就此把温病独立于伤寒之外。这一点，已经经过千百年无数医者治疗验证过的，是《黄帝内经》等经典确认的，不能因为一个或者几个医案就全盘否定。”
叶知秋傻眼了，他想不到孙奇他们到现在还是不相信温病不同于伤寒，原因很简单，千百年的东西，想用几个病案就全部推翻，缺乏说服力。他不想再争辩，争辩也没用。
孙兆见他沮丧的样子，还以为他认识到自己看法的错误了，忙笑着扯开了话题，问他在王府的情况，又说了很多感激鼓励的话。
叶知秋的心情不可能一下子好起来，原以为皇帝的病案能证明自己原本正确的理论，但是却想不到这个结果，由此也知道，当初温病跟伤寒脱离出来是经历了何等的艰难。
鉴于孙奇在这次的功劳，和对孙用和的愧疚，仁宗下旨提升孙奇为侍御医，填补了孙用和原先的职位。孙家自然是欢喜异常。
叶知秋和可馨回来之后，叶知秋本来是想告诉王妃他们两人的事的，但可馨不让，说要等他成亲之后再说。
而吴王和王妃已经从解救他们出来的将官嘴里得知了他跟一个青楼女子掉进地洞，一起在里面呆了半个月，估计两人关系不同一般，但是，儿子既然不说，他们也不问。
可馨回来之后，果然闭门谢客。很快，叶知秋在吴王府外不远处租了一套住宅，可馨搬出来可馨楼，住进了他们的金屋。叶知秋平素没有事情的时候就去和可馨相聚。两人好得如胶似漆似的。