远洋舰队走过一遍后，西班牙人的自信心就被打没了。对于这种能打到自己，自己却不能打到的大船，任是谁面对也心慌呀。
现在已经有三十多艘西班牙船被击伤，张千方还不满足，又带着舰队绕了一个圈子转了回来，准备开始进行第二轮蹂躏。这回西班牙船学乖了，远远地就想要躲开，只是西班牙船队是密集阵形，一时又哪里有地方躲呢？
于是远洋舰队又插入西班牙船队中开炮，而水兵们则拿着火铳，对着自己能看到的西班牙人射击。这时候退往马尼拉的陈厚甫和颜思齐接到报告后，立即倾巢而出，后面的郑芝龙也见机会难得，加入了趁火打劫的行列。
就着下午的日光，在马尼拉外海展开的这一场海战对西班牙海军的打击是覆灭性的。明军以远洋舰队为主力，前面有陈厚甫和颜思齐的舰队，后面是郑芝龙的舰队，西班牙人不仅仅是战败，而且是惨败。
西班牙舰队长于冲撞与登船作战，其火力主要布置在舰首和舰尾，而明军火力主要在于舷侧，而且明军火炮射程较远，火力更强，使得西班牙登船作战的武装士兵根本没有用武之地。
这一战，从棉兰老岛打到马尼拉，西班牙两百二十艘船仅仅逃走了二十艘，西班牙人战死约八百人，被俘虏共约一万七千多人。缴获船只一百七十六艘，另有二十四艘已经被烧得无法使用。
本来在与英格兰战斗后西班牙已经处于颓势，这一战，几乎将西班牙的海军机动战力一扫而空。这对于葡萄牙人来说是一个极大的喜讯。
布拉干萨公爵的亲信阿布兰自然非常高兴，他对大明的官员将领们说道：“请转告尊敬的大明皇帝陛下，外臣回到葡萄牙后，将会对公爵阁下进言，我们葡萄牙将位于印度的殖民地果阿和达曼-第乌两地，以及东帝汶都送给大明，只继续租借在澳门进行商务活动。”
当然，这样的承诺到底能不能算数，阿布兰说了是不能算的。不过大明有信心在葡萄牙人不遵守承诺的情况下用武力征服这三处殖民地，不过如果不需要战争那当然会更好。
周延儒说道：“贵使上次就已经对大明南海经略黄公说了这样的条件，这也是我们大明愿意出兵来攻打马尼拉的原因。希望你们的公爵大人能够认清与大明友好的重要性，我们的皇帝陛下希望在遥远的欧洲，能够有一个有力的盟友，大家守望相助，一起领导这个新世界。”
葡萄牙人的另一个将领阿贝德说道：“我们公爵大人一定会珍惜与大明的友谊，我们这次会回去，协助公爵大人一起来脱离西班牙。至于我们答应大明转让殖民地的承诺一定会遵守，请大明相信我们的诚意。”
颜思齐笑道：“下次我们想去欧洲游玩一番，到时还要请两位带我们多走些地方哟。”
阿布兰脸色一紧，然后笑道：“那是当然。不过西班牙帝国力量极其强大。他们在三年内就可以凭借在美洲取得的军费轻易地建立起一支超过三万人的舰队，而且在陆战中，其西班牙步兵方阵已经称雄欧洲很多年。我们葡萄牙的独立之路只怕还会有些麻烦。”
张千方大喜道：“那好，我们远洋舰队跟着你们去欧洲，帮你们将西班牙打垮，这样你们就不会有麻烦了。”
阿布兰连忙摆手强笑道：“这就不劳大明了，我们公爵大人会有方法对付西班牙人的。”真是笑话，如果大明去了欧洲，打败了西班牙后，只怕葡萄牙人要成为大明的属国了。
当然张千方也不可能去欧洲，他接到的命令是去美洲，自然不可能抗旨。再说他十艘船去美洲倒还可以耀武扬威，但跑到欧洲去，只怕骨头都会让人吃掉。
送走了阿布兰和阿贝德后，大明官员再开了一个会。戴春风说道：“葡萄牙人说西班牙在美洲取得军费，这倒是让我想起来，张中将这次去美洲，顺便可以将西班牙人的财源抢过来，这样西班牙人没钱了看他们怎么复仇。”
张千方眼睛一亮：“这倒是个办法，虽然皇上说我们是去找树种，但我们这样全副武装地去，只是取些树种回来，确实有些不甘心呀。”
周延儒担心地说道：“可是皇上说过不要轻易启衅呀，我们总不能主动去攻击西班牙人吧。”
颜思齐笑道：“如果西班牙人不攻击你们，当然没有问题，但是如果他们先攻击，那你们还击总可以吧。”
周延儒点了点头说道：“那倒是没有问题，皇上说过的，不要在海外丢了大明的面子。”
戴春风道：“那就行了，西班牙人会先攻击你们的，这一点可以放心。”
周延儒还是不懂，不过他看到那些将领脸上露出的怪笑，心里一激灵，明白了过来。他心想，自己是没办法干涉军事的，如果说得多了，张千方根本不会给自己面子，那时可就麻烦了。反正打赢了功劳有自己一份，打输了自己一点责任都没有。他们想打那就打吧。
张千方在马尼拉停留了三天，补充了武器弹药，粮食淡水，特别是一些耐储存的瓜果蔬菜，便向着遥远的美洲而去。
西班牙在前面被抓的菲利普等人还没有被赎回，这次又来了这么多的俘虏，大明众官将商量了一下，决定就将他们运回台湾，由黄克缵决定是继续往北运还是在台湾做劳工。
黄克缵也不敢自作主张，便奏报到京城。朱由校批示：让西班牙人去建设台湾，修筑道路开垦荒地，这样西班牙人来赎回时近一些。
西班牙人既然已经大败，那么棉兰老岛的危机便全面解除，苏禄国王非常感谢明军的帮助，在了解到吕宋的局势后，立即派人带着苏禄图表户籍前往京城，称愿意并入大明。